La investigación suele emplear cultivos de hepatocitos, modelos de células estrelladas hepáticas y sistemas de explantes de tejido hepático para investigar las vías asociadas a la fibrosis. Los criterios de valoración habituales incluyen la síntesis de colágeno, la regulación de la matriz extracelular, los marcadores de activación de las células estrelladas y los cambios transcripcionales asociados a la remodelación tisular y a las respuestas celulares al estrés.

Los estudios experimentales emplean con frecuencia cultivos de células epiteliales intestinales y modelos de función de barrera para evaluar la integridad epitelial y la homeostasis celular. Las mediciones habituales incluyen la expresión de proteínas de uniones estrechas, ensayos de permeabilidad, marcadores de función de barrera y vías de señalización implicadas en el mantenimiento epitelial y la resiliencia tisular.

Los modelos de infección basados en células se utilizan habitualmente para examinar las interacciones entre las vías de replicación viral y las respuestas de la célula huésped. Los criterios de valoración habituales incluyen marcadores de replicación viral, respuestas celulares al estrés, vías de señalización inflamatoria y cambios de expresión génica específicos de tejido, lo que permite a los investigadores determinar si los efectos observados se asocian a una modulación directa de los procesos de replicación o a mecanismos reguladores celulares más amplios.