La ricerca utilizza comunemente colture di epatociti, modelli di cellule stellate epatiche e sistemi di espianti di tessuto epatico per indagare le vie associate alla fibrosi. Gli endpoint tipici includono la sintesi di collagene, la regolazione della matrice extracellulare, i marcatori di attivazione delle cellule stellate e le variazioni trascrizionali associate al rimodellamento tissutale e alle risposte cellulari allo stress.

Gli studi sperimentali impiegano frequentemente colture di cellule epiteliali intestinali e modelli di funzione di barriera per valutare l'integrità epiteliale e l'omeostasi cellulare. Le misurazioni più comuni includono l'espressione delle proteine delle giunzioni strette, saggi di permeabilità, marcatori della funzione di barriera e vie di segnalazione coinvolte nel mantenimento epiteliale e nella resilienza tissutale.

I modelli di infezione su base cellulare sono comunemente utilizzati per esaminare le interazioni tra le vie di replicazione virale e le risposte della cellula ospite. Gli endpoint tipici includono marcatori di replicazione virale, risposte cellulari allo stress, vie di segnalazione infiammatoria e variazioni dell'espressione genica tessuto-specifiche, consentendo ai ricercatori di caratterizzare se gli effetti osservati siano associati a una modulazione diretta dei processi di replicazione o a meccanismi regolatori cellulari più ampi.