Los analizadores de flujo extracelular (plataformas de respirometría tipo Seahorse) y los electrodos de oxígeno tipo Clark son herramientas estándar para medir el efecto de BAM-15 sobre la tasa de consumo de oxígeno (OCR) en preparaciones celulares y de mitocondrias aisladas. Los investigadores suelen medir la respiración basal y después introducir BAM-15 para evaluar la magnitud de la respiración desacoplada (consumo de oxígeno no acoplado a la síntesis de ATP), seguida de titulaciones con oligomicina e inhibidores de la cadena de transporte de electrones para resolver por completo el perfil bioenergético y confirmar el mecanismo de transporte de protones.

Para medir los cambios en el potencial de membrana mitocondrial tras la exposición a BAM-15 se utilizan colorantes potenciométricos fluorescentes (como TMRM o JC-1) combinados con citometría de flujo o microscopía de fluorescencia, lo que permite a los investigadores cuantificar el grado de disipación del gradiente de protones en un intervalo de concentraciones. Estas mediciones suelen acompañarse de ensayos paralelos de niveles de ATP para caracterizar la relación entre los cambios del potencial de membrana y las consecuencias bioenergéticas posteriores en el modelo celular concreto en estudio.

La investigación bioenergética comparada ha examinado BAM-15 frente a otros compuestos de la clase de los protonóforos, con especial interés en los perfiles de selectividad que distinguen los efectos sobre la membrana mitocondrial interna de los efectos sobre la membrana plasmática. Estos estudios suelen emplear ensayos paralelos de OCR y de potencial de membrana con varios desacoplantes a concentraciones equivalentes, lo que permite a los investigadores caracterizar la potencia relativa, las ventanas de selectividad y las relaciones estructura-actividad dentro de esta clase de compuestos.