Gli analizzatori di flusso extracellulare (piattaforme di respirometria tipo Seahorse) e gli elettrodi per ossigeno di tipo Clark sono strumenti standard per misurare l'effetto di BAM-15 sul tasso di consumo di ossigeno (OCR) in preparazioni su base cellulare e di mitocondri isolati. I ricercatori misurano tipicamente la respirazione basale, quindi introducono BAM-15 per valutare l'entità della respirazione disaccoppiata (consumo di ossigeno non accoppiato alla sintesi di ATP), seguita da titolazioni con oligomicina e inibitori della catena di trasporto degli elettroni per definire completamente il profilo bioenergetico e confermare il meccanismo di trasporto dei protoni.

Coloranti potenziometrici fluorescenti (come TMRM o JC-1) combinati con citometria a flusso o microscopia a fluorescenza vengono utilizzati per misurare le variazioni del potenziale di membrana mitocondriale dopo l'esposizione a BAM-15, consentendo ai ricercatori di quantificare il grado di dissipazione del gradiente protonico in un intervallo di concentrazioni. Queste misurazioni vengono generalmente affiancate da saggi paralleli dei livelli di ATP per caratterizzare la relazione tra le variazioni del potenziale di membrana e le conseguenze bioenergetiche a valle nello specifico modello cellulare in esame.

La ricerca bioenergetica comparativa ha esaminato BAM-15 rispetto ad altri composti della classe dei protonofori, con particolare interesse per i profili di selettività che distinguono gli effetti sulla membrana mitocondriale interna da quelli sulla membrana plasmatica. Tali studi impiegano generalmente saggi paralleli di OCR e del potenziale di membrana su più composti disaccoppianti a concentrazioni equivalenti, consentendo ai ricercatori di caratterizzare la potenza relativa, le finestre di selettività e le relazioni struttura-attività all'interno di questa classe di composti.